Para alterar a cor da seleção dos textos em sua loja, acesse:

Minha loja > Design da loja  > Editar tema > Configurações Gerais > Seleção de textos :

Neste campo, podemos alterar a cor de fundo e a cor do texto quando fizer uma seleção do texto.

Usando como exemplo, nas configurações do tema, fiz a alteração das cores: 

Verifique como ficou no tema ao selecionar o texto :